הלימודים נמשכים שלוש שנים. להשלמת התואר נדרשות 132 נקודות זכות.
שנה א - קורסי חובה במקצועות הבסיס כגון: מתמטיקה, כימיה, פיסיקה וביולוגיה. במקביל נלמדים קורסים ראשוניים בנושאי סביבה, כמו "הכרת החי והצומח", "אדם וסביבה" ועוד.
שנה ב - קורסי העמקה במקצועות הליבה כגון: גיאולוגיה, מדעי הקרקע, סדנא באקולוגיה יישומית, כימיה סביבתית של המים, מיקרוביולוגיה, כלכלה סביבתית, סטטיטיסטיקה, שיטות מחקר, אנרגיה וסביבה ועוד. באמצע השנה השניה הסטודנטים מתבקשים לבחור בין שני מסלולי התמחות: קרקע ומים או אקולוגיה וחברה. בחירה זאת מחייבת אותם ללמוד מספר בקורסים בתחום בו בחרו להתמקד ופוטרת אותם מחובת לימוד של מספר קורסים מהתחום השני. סטודנטים שיבחרו במסלול קרקע ומים ילמדו קורסים מתקדמים בתחום כגון: טכנולוגיות לטיפול במים ושפכים, גיאוהידרולוגיה של משאבי המים בישראל וסדנא ישומית לטיפול במים. סטודנטים שיבחרו במסלול אקולוגיה וחברה ילמדו קורסים כגון: אקולוגיה כמותית של אוכלוסיות וחברות, חקיקה סביבתית וסדנא באקולוגיה ישומית.
שנה ג - קורסי התמחות בנושאים מתקדמים כגון: מערכות מידע גאוגרפיות (GIS) קורסי חקיקה סביבתית, מטאורולוגיה, ניהול חומרים מסוכנים, אקולוגיה כמותית, הידרולוגיה, טכנולוגיות טיפול במים, קורסי בחירה מגוונים.