מלגת אתנחתא מיועדת לסטודנטים המעוניינים לשלב יחד עם לימודי התואר, מפגש שבועי באווירה נעימה וברוח צעירה, ולהעמיק בתחומי המורשת והתרבות היהודית בליווי של צוות חם, צעיר ואנרגטי. התוכנית מתקיימת ב20 מרכזים ברחבי הארץ ממטולה ועד אילת ופונה לקהל צעירים וצעירות גדול ומגוון עד גיל 35. התכנית הינה שנתית וכוללת מפגשי שיח ולימוד, הרצאות, מיזמים קהילתיים, טיולים וסיורים, ימי גיבוש, ערבי תרבות יהודית וסופ"ש.
בתוכנית המלגות ניתן לצבור ולקבל עד 5,000 שח בשנה (בחלק מהמרכזים קיימת מלגה מורחבת של 10,000 ש"ח). ההשתתפות בתכנית כוללת כ 140 שעות.